Además de la Escuela Náutica, Columbus University es el segundo centro de formación de ingenieros náuticos oficiales de marina mercante de cubierta y máquina en Panamá.
Desde su creación en 1994, la Facultad de Ciencias Marinas y Tecnológicas de la Columbus University ha graduado 32 ingenieros náuticos. Actualmente cuenta con 140 estudiantes que se forman en ciencias náuticas con especialización en administración, transportación marítima, puertos y canales; o ciencias náuticas y mecánicas con especialización en motores y maquinaria naval.
La Universidad tenía una certificación provisional hasta cumplir con algunos aspectos que exige el convenio SCTW, como la utilización de simuladores en la formación de los estudiantes, una mayor cantidad de libros y la certificación de calidad ISO 9001.
De acuerdo con el capitán Luis Ruiz, decano de la Facultad de Ciencias Marinas, la Universidad cuenta con los software de simuladores en navegación, maniobras, cartas electrónicas, radar y meteorología. Además utilizan los servicios de los simuladores de la Autoridad del Canal de Panamá para transportación marítima y cubierta.
Durante la entrega de la certificación, la administradora de la AMP, Bertilda García, reconoció que la administración hace esfuerzos para estimular la formación de personal humano.