La gestión de José Raúl Mulino sigue haciendo cambios en la estructura del Ministerio de la Presidencia.
Primero fue la eliminación de la Secretaría de Seguimiento a la Ejecución y Cumplimiento que heredó de la administración de Laurentino Cortizo.
En su lugar, Mulino restableció la Secretaría de Metas Presidenciales, la cual está a cargo José Ramón Icaza, actual ministro de Asuntos del Canal de Panamá.
El más reciente cambio fue en la Secretaría Estratégica para el Desarrollo y Competitividad de la Presidencia de la República, creada en 2019.
Mulino decidió cambiarla y bautizarla como Secretaría de Asuntos Económicos y Competitividad del Ministerio de la Presidencia. Así quedó establecido en el Decreto Ejecutivo No. 486 del 16 de agosto de 2024.
Esta secretaría tiene la responsabilidad de coordinar, monitorear y evaluar las metas económicas que debe ejecutar el Estado. Tendrá un secretario ejecutivo de libre nombramiento y remoción. Deberá rendir informes directamente al mandatario.
El Ministerio de la Presidencia deberá incluir en su presupuesto las partidas necesarias para el funcionamiento de esta secretaría.

