El águila harpía (Harpia harpyja) es considerada hoy una especie en peligro de extinción. Internacionalmente está amparada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza y el Convenio sobre Comercio Internacional de Especies amenazadas de Fauna y Flora Silvestre.
En Panamá, el Fondo Peregrino, el Patronato Amigos del Águila Harpía, el Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales, la Autoridad Nacional del Ambiente (Anam) y la Asociación Nacional para la Conservación de la Naturaleza (Ancón), entre otras organizaciones, han unido fuerzas para salvar al ave nacional.
Actualmente se desconoce la población exacta en América Latina del ave rapaz. El Patronato Amigos del Águila Harpía estima, mediante un modelo digital, que en el istmo hay 209 parejas, gracias a los programas de cría y reintroducción de la especie del Fondo Peregrino-Panamá.

